Współpracował z magazynami „Gamestar”, „Click!”, „Komputer Świat i Gry” oraz czasopismami „Magia i Miecz”, „Nowa Fantastyka”. Pisze felietony w tygodniku „Do Rzeczy”. Jego opowiadania były publikowane w tomach zbiorowych między innymi: Robimy rewolucję (2000), Demony (2004), Niech żyje Polska hura! (t. 1, 2006), Idiota skończony (2018).
Debiutował w 1991 roku na łamach „Nowej Fantastyki” opowiadaniem Czarna cytadela; jego kolejne teksty ukazywały się w pismach „Voyager. Almanach Grozy i Fantastyki”, „Złoty Smok”, „Fenix”. W 1999 roku została wydana jego pierwsza książka, zbiór opowiadań zatytułowany Opowieści z Dzikich Pól.
Twórczość Jacka Komudy koncentruje się na postaciach i wydarzeniach historycznych, głównie z okresu Rzeczpospolitej Obojga Narodów, umiejscowionych przede wszystkim na jej południowo-wschodnich terenach, które są bogate w gęste ciemne lasy, grobowce, a także tajemnicze ruiny dworków i fortec. Paweł Dunin-Wąsowicz określił jego twórczość mianem „fantasy kresowej”, która ma zabarwienie baśniowe, ludowe. Opiera się bowiem na wierzeniach oraz proroczych wizjach zawartych w snach bohaterów.
Komuda swobodnie łączy różne gatunki literackie – fantasy, powieści grozy, historyczną, przygodową, gawędę szlachecką, baśń, a także wykorzystuje legendy i podania. Wplata w język współczesny archaizmy, scalając w ten sposób oparte na dokumentach historycznych fakty z pisarską wyobraźnią.
Ponadto Jacek Komuda podejmuje dialog z Henrykiem Sienkiewiczem i jego sposobem przedstawienia Rzeczpospolitej szlacheckiej. Heroiczni bohaterowie polskiej historii stają się w twórczości Komudy ludźmi mającymi słabości i wady, a mityczne Kresy Wschodnie, kojarzone dziś z minioną tradycją polskiego dworu i drobną szlachtą zaściankową – miejscem krwawych pojedynków oraz manifestacji nadprzyrodzonych mocy i nieujarzmionych sił.
Za powieść Galeony wojny w 2009 roku otrzymał Nagrodę im. Leonida Teligi, w tym samym roku był także nominowany do Nagrody Literackiej im. Jerzego Żuławskiego za książkę Diabeł Łańcucki. Otrzymał również Statuetkę Strażnika Pamięci 2023 w kategorii „Twórca” (redakcja tygodnika „Do Rzeczy” doceniła jego powieści: Diabła Łańcuckiego i Banitę z czasów sarmackich oraz Hubala, Westerplatte i Wiznę z czasów drugiej wojny światowej).
Jego opowiadania są publikowane między innymi w ukraińskich i rosyjskich antologiach (2016, 2017).