Zadebiutowała powieścią Jowanka i gang spod Gilotyny (2015). Jest laureatką nagrody „Guliwera w krainie Olbrzymów” (2016) przyznawanej przez kwartalnik „Guliwer”. Za powieść dla nastolatków Kobra otrzymała wyróżnienie w Nagrodzie Literackiej im. Kornela Makuszyńskiego (2019), za powieść Świat Mundka (z ilustracjami Roberta Konrada) została wyróżniona w konkursie Książka Roku Polskiej Sekcji IBBY (2020) i nominowana w pierwszej edycji konkursu Literacka Podróż Hestii (2021).
Za zbiór opowiadań Kilka niedużych historii (ilustracje Joanna Rusinek) była uhonorowana Nagrodą Główną w Konkursie Świat Przyjazny Dziecku organizowanym przez Komitet Ochrony Praw Dziecka (2022). Za książkę Już, już! (z ilustracjami Roberta Konrada) otrzymała Nagrodę Główną – Koziołka oraz Nagrodę Czytelników w ramach Nagrody Literackiej im. Kornela Makuszyńskiego (2022), była nominowana do Nagrody im. Ferdynanda Wspaniałego (2022) oraz w konkursie Literacka Podróż Hestii (2022). Witajcie w Chudegnatach przyniosły jej II Nagrodę w Konkursie Literackim im. Astrid Lindgren (2023) w kategorii „powieść dla dzieci od sześciu do dziesięciu lat”. Powieść ta (z ilustracjami Anny Oparkowskiej) była też nominowana w konkursie Książka Roku Polskiej Sekcji IBBY (2024).
W 2025 roku pisarka otrzymała dwie ważne nagrody: Nagrodę Główną Konkursu Świat Przyjazny Dziecku za Wielki Bieg Gwiazdkowy (ilustracje Agnieszka Sozańska) oraz Nagrodę Główną – Koziołka w ramach Nagrody Literackiej im. Kornela Makuszyńskiego za powieść Witajcie w Chudegnatach. Od 2023 roku Katarzyna Wasilkowska zasiada w kapitule konkursu Literacka Podróż Hestii.