Współpracował z „Gazetą Wyborczą”, „Tygodnikiem Powszechnym” i „Dwutygodnikiem”. Jest członkiem-założycielem Unii Literackiej, a od 2023 roku prezesem Ogólnopolskiego Towarzystwa Ochrony Ptaków. Jego książki łączą literacką wrażliwość z pasją przyrodniczą i refleksją nad współczesnym światem. Angażuje się w liczne działania związane z ochroną środowiska i edukacją ekologiczną.
Debiutował reportażem historycznym Pirat stepowy (2012), w którym przywrócił pamięć o ukraińskim robotniku, rewolucjoniście, anarchiście i przywódcy powstania chłopskiego Nestorze Machno. Pirat stepowy to opowieść o wolności, utopii i dramatycznych wyborach w czasach wojny. Została przetłumaczona na język chorwacki i ukraiński.
Przełomowa dla Stanisława Łubieńskiego okazała się książka Dwanaście srok za ogon (2016) – zbiór esejów o ptakach, kulturze i ludzkiej tęsknocie za naturą. Autor z lekkością połączył w niej obserwacje przyrodnicze z literaturą, sztuką i historią, tworząc opowieść, która zachwyciła czytelników i krytyków. Książka zdobyła Nagrodę Czytelników „Nike” i była nominowana do innych polskich nagród literackich. Ukazała się w przekładach na języki angielski i francuski.
W Książce o śmieciach (2020) Łubieński podjął temat globalnego kryzysu związanego z nadprodukcją odpadów. Eseje, ilustrowane zdjęciami autora, pokazują, jak śmieci kształtują krajobraz i kulturę – od polskich lasów po azjatyckie plaże. Książka o śmieciach to literatura zaangażowana, która inspiruje do zmiany codziennych nawyków i baczniejszego przyglądania się otoczeniu.
Najnowsza książka, Drugie życie Czarnego Kota (2025), to poetycka opowieść o przyrodzie w mieście. Łubieński uczy, jak dostrzegać dzikość w betonowej dżungli – w ruderalnych roślinach, ptakach zamieszkujących ruiny i porostach na pomnikach. Jego książka zmienia sposób patrzenia na przestrzeń miejską i relację człowieka z naturą.
Twórczość Stanisława Łubieńskiego jest uniwersalna – łączy humanistykę z ekologią, lokalność z globalnymi problemami. Jego erudycyjny, a zarazem przystępny styl pisania sprawia, że książki trafiają do szerokiego grona odbiorców, od miłośników literatury po aktywistów i edukatorów. Autor nie tylko pisze, ale także działa – prowadzi spacery przyrodnicze po Warszawie, blog „Dzika Ochota” i audycję „Księstwo Ptaków” w radiowej Trójce. Literatura Łubieńskiego otwiera oczy na zniszczony przez człowieka świat przyrody, który wciąż możemy jeszcze ocalić.
Stanisław Łubieński jest laureatem Nagrody Warszawskiej Premiery Literackiej (2016), Nagrody Czytelników „Nike” (2017) oraz nagrody głównej w konkursie Planeta Izabelin (2021). Był dwukrotnie nominowany do Nagrody Literackiej „Nike” (2017 i 2021), dwukrotnie do Paszportu „Polityki” (2016 i 2025) oraz jeden raz do Nagrody Literackiej Gdynia (2017).