Jest absolwentem Wydziału Architektury Politechniki Gdańskiej, obronił dyplom w Katedrze Historii Architektury Polskiej. Twórca serii Rewolucje, Blaki i Morfołaki, poza autorskimi albumami publikował w magazynach komiksowych w Polsce i za granicą. Wspólnie z Nikodemem Skrodzkim założył i prowadził czasopismo „VormkfasA. Magazyna Komiksowa”.
Zapoczątkowana w 2004 roku seria Rewolucje uznawana jest za pierwszy polski komiks steampunkowy – osadzony w stylizowanych realiach końca XIX wieku rozszerzonych o fantastyczne wynalazki i mityczne artefakty, konfrontujący potęgę ludzkiego umysłu z siłami natury i tym, co nadprzyrodzone, utrzymany w atmosferze niesamowitości mieszającej się z absurdem. Bohaterami mroczniejszych Morfołaków są tytułowe stworzenia egzystujące na granicy marzeń sennych i rzeczywistości, miewające przy tym kontakty z ludźmi. Tematyka tomów z tej serii dotyka kwestii relacji między jawą a snem, między prawdą a fikcją. Również w Blakim Skutnik nie stroni od oniryzmu, przy czym seria ta koncentruje się w pełni na jednym bohaterze – filozofującym pesymiście – i jego przemyśleniach o rozmaitych aspektach społecznej rzeczywistości i sposobach postępowania jednostek.
Narrację wizualną Skutnik uprawia również w dziedzinie gier wideo; stworzył między innymi serie Daymare Town i Submachine; tę drugą rozwija w dalszym ciągu, przenosząc ją obecnie do medium gier karcianych i planszowych. Współpracował z teatrem tańca: do spektaklu Viva La Vida Teatru Okazjonalnego z Sopotu stworzył komiksową scenografię na podstawie twórczości Fridy Kahlo. Na potrzeby oprawy wizualnej spektakli przygotowywał również produkcje filmowe. Jako scenarzysta pracował przy produkcji filmu Kinematograf w reżyserii Tomasza Bagińskiego.
Więcej na temat twórczości Mateusza Skutnika znaleźć można na stronie internetowej www.mateuszskutnik.com.